中國(guó)對(duì)菌肥的研究和應(yīng)用起步較早，1950年開始對(duì)根瘤菌、抗生菌等多種菌劑進(jìn)行了全面的研究和應(yīng)用。國(guó)內(nèi)農(nóng)業(yè)上應(yīng)用Z廣泛的是根瘤劑，其次是抗生菌劑和固氮菌劑，近年來(lái)磷細(xì)菌劑和鉀細(xì)菌劑應(yīng)用也日趨廣泛。2002年后，又出現(xiàn)了集造肥、促生、抗病、抗逆、改良土壤等多功能于一身的放線菌類微生物菌劑。生物有機(jī)肥是由微生物菌劑和優(yōu)質(zhì)有機(jī)肥混合而成的生物肥料，在生產(chǎn)實(shí)踐中效果較明顯，成為部分或全部替代化肥的新生力量。

在微生物肥料中，以根瘤菌劑的研究和應(yīng)用為Z早和Z廣泛。20世紀(jì)初，歐美的一些國(guó)家開始根瘤菌劑的商品生產(chǎn)。根瘤菌肥主要含有根瘤菌。根瘤菌與豆科作物共生，利用豆科植物提供的養(yǎng)料進(jìn)行生物固氮。磷鉀細(xì)菌劑的應(yīng)用研究始于20世紀(jì)60年代。鉀細(xì)菌肥料又稱生物鉀肥、硅酸鹽菌劑，其主要成分是硅酸鹽細(xì)菌。固氮菌肥料能在常溫常壓下利用空氣中的氮?dú)庾鳛榈仞B(yǎng)料，將分子態(tài)氮還原為氨，產(chǎn)生固氮作用。施用生物鉀肥是緩解我國(guó)鉀肥不足、改善土壤大面積缺鉀狀況的有效措施。生產(chǎn)中需要注意的是，鉀細(xì)菌肥料本身不含有鉀肥，所以應(yīng)用時(shí)仍要配施鉀肥。磷細(xì)菌肥料就是能把土壤中的無(wú)效磷轉(zhuǎn)化成有效磷的一種微生物制劑。放線菌是化解有機(jī)營(yíng)養(yǎng)型的微生物，分解有機(jī)碳化物獲得碳源和能源。復(fù)合菌肥由一種以上的微生物菌劑復(fù)合而成，如EM。